АҚШ-тың Ауруларды бақылау және алдын-алу орталығы, CDC, SARS-CoV-2 дәйектілігі туралы мәліметтерді көпшілікке жариялауды жылдамдатуға мүмкіндік беретін ұлттық секвенциялық зертханалар желісін бастау үшін консорциумды іске қосты. Ашық коронавирус дәйектілігі туралы деректерді жылдам шығару нұсқаулыққа көмектеседі КОВИД-19 денсаулық сақтау саласына ден қою, инновациялар мен ашылуларға жетелеу, осы және болашақ пандемияларды алдын-ала түсіну.
осы SARS-CoV-2 төтенше жағдайларға, эпидемиологияға және қадағалауға арналған денсаулық сақтау тізбегі (SPHERES) қолдануды едәуір кеңейтетін консорциум бүкіл геномды тізбектеу (WGS) COVID-19 вирусынан. SPHERES бүкіл ел бойынша COVID-19 жағдайлары мен кластерлерін тергеп жатқан қоғамдық денсаулық сақтау топтарына дәйекті, нақты уақыттағы дәйектілік туралы деректерді ұсынады.
Бұл жаңа консорциум вирустың ұлттық және жергілікті қауымдастықта қалай таралатынын жақсы түсінуге көмектеседі. Жақсырақ мәліметтер, өз кезегінде, денсаулық сақтау органдарының қызметкерлеріне берілу тізбегін тоқтатуға, аурудың жаңа жағдайларын болдырмауға, өмірді қорғауға және сақтауға көмектеседі.
«АҚШ геномның жылдам секвенизациясы бойынша әлемдегі көшбасшы болып табылады. Біздің қоғамдық, жеке, клиникалық және академиялық қоғамдық денсаулық сақтау зертханаларымыздағы бұл үйлестірілген күш SARS-CoV-2 берілуін, эволюциясы мен емделуін түсінуде маңызды рөл атқарады. Біздің ең жақсы, білікті ақыл-ойларымыз бүгінгі және ертеңгі өмірді сақтап қалуға көмектесу үшін бірлесе жұмыс істейтініне сенімдімін », - деді CDC директоры Роберт Редфилд, м.ғ.д.
COVID-19 вирусының дамуын қадағалау
Геномдық дәйектілік туралы мәліметтер COVID-2 қоздырғышын тудыратын SARS-CoV-19 вирусының биологиясы туралы бұрын-соңды болмаған түсінік бере алады және пандемияның өзгеретін ландшафтын анықтауға көмектеседі. Құрама Штаттардан келген вирустардың тізбегін құру арқылы CDC және басқа да денсаулық сақтау органдары вирустағы маңызды өзгерістерді бақылап, осы ақпаратты контактілерді қадағалау, халықтың денсаулығын төмендету бойынша шаралар және инфекцияны бақылау стратегиялары үшін қолдана алады.
SPHERES консорциумы - SARS-CoV-2 геномының ұлттық тізбегін үйлестіру бойынша ауқымды күш, ондаған жеке, жеке күштерді зертханалардың, мекемелердің және корпорациялардың таралған желісіне біріктіреді. Консорциум 40 мемлекеттік және жергілікті қоғамдық денсаулық сақтау департаментінің, бірнеше ірі клиникалық зертханалардың және федералды үкіметтің, академиялық және жеке сектордың жиырмадан астам бірлескен мекемелерінің тәжірибесін, технологиясын және ресурстарын біріктіреді.
SPHERES алдыңғы қатарлы технологияларды ұлттық COVID-19 реакциясына жеткізуге көмектесетін ең жақсы тәжірибе мен консенсус деректерін стандарттарын орнатады, ашық мәліметтермен алмасуды жеделдетеді және ресурстар мен тәжірибелер қорын қалыптастырады.
SPHERES деректері ашық, ортақ
Консорциум мүшелері ашық тізбекті тез бөлісу туралы міндеттеме алады. Олар барлық дәйектілік туралы деректерді Ұлттық Медицина Кітапханасының Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығындағы (NLM / NCBI), Құс тұмауының деректерін (GISAID) бөлісу жөніндегі жаһандық бастамадағы және басқа да қоғамдық репозитарийлердегі қоғамдық қоймаларға жіберуді жоспарлап отыр. Бұл Америка Құрама Штаттарынан алынған вирустық дәйектілік туралы деректердің денсаулық сақтау саласындағы шешімдер қабылдау үшін тез қол жетімді болуына және барлық жерде зерттеушілерге еркін қол жетімді болуына көмектеседі.
Консорциум мүшелері:
Федералды агенттіктер мен зертханалар
Ауруларды бақылау және алдын алу орталықтары, кеңейтілген молекулярлық детекторлар бөлімі
Аргонне ұлттық зертханасы
Қорғаныс денсаулық сақтау агенттігі, Ғаламдық инфекциялық ауру қадағалау
Азық-түлік және дәрі-дәрмектерді басқару
Лоренс Беркли ұлттық зертханасы
Los Alamos ұлттық зертханасы
Ұлттық аллергия және инфекциялық аурулар институты, Геномика және озық технологиялар бөлімі
Ұлттық стандарттар мен технологиялар институты
Ұлттық медицина кітапханасының Ұлттық биотехнологиялық ақпарат орталығы
Вальтер Рид атындағы Армия ғылыми-зерттеу институты
Мемлекеттік / жергілікті қоғамдық денсаулық сақтау зертханалары
Аризона
Калифорния
Delaware
Колумбия округі
Флорида
Гавайи
Maine
Maryland
Массачусетс
Мичиган
Minnesota
Солтүстік Каролина
Солтүстік Дакота
Невада
New Mexico
Нью-Йорк
Юта
Вирджиния
Вашингтон
Висконсин
Wyoming
Оқу мекемелері
Байлор университеті
Корнелл университеті
Фред Хатчинсон қатерлі ісігін зерттеу орталығы
Синай тауындағы медицина мектебі
Нью-Йорк университеті
Солтүстік Аризона университеті
Буффало университеті
Калифорния университеті, Беркли
Калифорния Университеті, Дэвис
Калифорния университеті, Ирвин
Калифорния университеті, Лос-Анджелес
Калифорния Университеті, Сан-Франциско
Калифорния университеті, Санта-Крус
Чикаго университеті
Мэриленд университеті
Миннесота университеті
Небраска университеті
Нью-Мексико университетінің
Вашингтон университеті
Йель университеті
Корпорациялар
Эбботт диагностикасы
bioMerieux
Түс геномикасы
Gingko Bioworks
IDbyDNA
In-q-тел
Лабкорп
Бір кодекс
Oxford Nanopore Technologies
Тынық мұхиты биологиясы
Циаген
Квест диагностикасы
Шындығында өмір туралы ғылымдар
Корпорациялардың атаулары тек ақпараттық мақсаттарда беріледі және оларды осында қосу корпорациялардың немесе олардың кез-келген коммерциялық өнімдерінің немесе қызметтерінің АҚШ-тың Ауруларды бақылау және алдын алу орталығының мақұлдауын білдірмейді.
Коммерциялық емес денсаулық сақтау немесе ғылыми-зерттеу институттары
Қоғамдық денсаулық сақтау зертханаларының қауымдастығы
Билл мен Мелинда Гейтс Қоры
Кең институт
Чан Цукерберг BioHub
Крейг Вентер институты
Геномдық эпидемиологияға арналған қоғамдық денсаулық сақтау альянсы
Scripps зерттеуі
Джексон зертханасы
Трансмиссиялық геномика институты - Солтүстік
Уолдер қоры
Соңғы алты жыл ішінде CDC-тің молекулаларды анықтау кеңейтілген бағдарламасы федералды және мемлекеттік денсаулық сақтау зертханаларына патогендердің геномикасын және басқа да озық зертханалық технологияларды жұқпалы ауруларды бақылау және эпидемияға қарсы іс-қимыл үшін кеңейту үшін инвестициялады. Ағымдағы консорциум инвестициясы SARS-CoV-2 пандемиясындағы өмірді сақтап қалуға және АҚШ пен әлемді болашақ пандемияға жауап беруге даярлауға бағытталған.
Геномдық секвенция немесе CDC-тің молекулалық детективтегі жұмысы туралы көбірек білу үшін кіріңіз https://www.cdc.gov/amd/
